Pro lidi alergické na plísně nebo roztoče může být klimatizace užitečná zejména během vlhkého léta, neboť ochlazením a odvlhčením vzduchu se v místnosti zhoršují podmínky pro množení plísní a roztočů. Klimatizace vybavené kvalitní filtrací pak pomáhají i lidem přecitlivělým na pylové a zvířecí alergeny. Samotný chladnější vzduch přináší úlevu pro dýchací cesty podrážděné alergií.